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郭安源

时间:2009-12-29     浏览次数:


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郭安源
职称职务 三级教授、博士生导师、华中学者 
学科专业 生物信息学
联系方式 027-87793177 (电话及传真)
电子邮箱 guoay@hust.edu.cn
 
教育经历

2002年 南开大学 生物化学学士

2007年 北京大学 生物信息学博士 

工作经历

2007-2009 美国弗吉尼亚联邦大学和范德堡大学 博士后

2009.10-至今 十大网赌靠谱平台十大正规网赌网址教授、博导

学术兼职 Journal of Metabolomics & Systems Biology杂志的编辑
           Frontiers in Bioinformatics and Computational Biology和Frontiers in Genomic Assay Technology的review editor
研究方向

生物信息学,癌症基因组学

包括生物信息数据库和肿瘤免疫分析方法开发,癌症多组学数据挖掘及调控网络分析,癌症发生发展机制及标志物发现,细胞外囊泡的作用机制研究等。


近年的科研项目、专著与论文、专利、获奖

国家自然科学基金委“优青”获得者(2018),教育部新世纪优秀人才(2012),华中学者特聘岗;

主要研究成果:在数据库构建、miRNA和转录因子共调控网络分析、癌症基因组挖掘和细胞外囊泡调控等方面有深入研究。围绕转录因子和非编码RNA建立了一系列有一定国际影响的数据库,如AnimalTFDB、hTFtarget、miRNASNP、lncRNASNP和EVmiRNA等(http://bioinfo.life.hust.edu.cn/),其中AnimalTFDB和miRNASNP各被引用300多次。发展了转录因子和miRNA在复杂疾病中的共调控模块和网络研究(FFLtool),运用该方法发现了白血病和肿瘤微泡等研究中的重要调控因子。开发了基因集的癌症多组学分析平台GSCALite、特异表达基因工具SEGtool、T细胞丰度预测方法ImmuCellAI、癌症细胞系鉴定方法CCLA和TCR丰度预测方法CATT等。

发表论文70余篇,总引用5000余次(google)。近5年来以通讯作者在Nucleic Acids Research、Cancer Research、Cell Reports、Theranostics、Briefings in Bioinformatics、Bioinformatics等权威期刊发表论文近30多篇,包括多篇ESI高被引论文(2019.12月ESI网站显示高被引通讯作者论文3篇)。

2011年以来,先后主持国家自然科学基金5项,参与科技部重大项目2项。在国际上最大的计算生物学会议ISMB和全国各级生物信息大会做过邀请报告。担任系统生物学分会、医药生物信息技术分会、血液病精准诊疗专业委员会、中国抗癌协会非编码肿瘤标志物分会肿瘤测序与大数据分析专委会等多个协会委员、常委等。担任自然科学基金生命学部、医学部函评评委和精准医学重点研发会评评委。担任Scientific Reports等多个杂志的编委。

教学育人工作:主讲本科生《生物信息资源与实践》和《生物信息Perl编程》,曾讲授《生物信息学》《系统生物学进展》等课程。获评“优秀本科生班主任”,“大学生科技创新优秀指导教师”,“湖北省优秀博士论文指导教师”,“湖北省优秀学士论文指导教师”,本科教学质量二等奖。所指导研究生中超过10人次获得研究生国家奖学金。1名博士生获得“湖北省优秀博士学位论文”,另1名博士生获“三好研究生标兵”(全校共10人)。已毕业博士生中,1人在211高校获得正教授职位,多人被评为副教授。


近五年代表性论文

10篇代表论文(通讯作者)

1. Xie GY, Xia M, Miao YR, Luo M, Zhang Q#, Guo AY#. FFLtool: A Web Server for Transcription Factor and miRNA Feed Forward Loop Analysis in Human. Bioinformatics. btz929. 2019  In Press

2. Zhang L, Lei Q, Wang H, Xu C, Liu T, Kong F, Yang C, Yan G, Sun L, Zhao A, Chen W, Hu Y, Xie H, Cao Y, Fu F, Yuan G, Chen Z, Guo AY#, Li Q#. Tumor-derived extracellular vesicles inhibit osteogenesis and exacerbate myeloma bone disease. Theranostics. 2019 Jan 1;9(1):196-209.

3. Liu T, Zhang Q, Zhang J, Li C, Miao YR, Lei Q, Li Q#, Guo AY#. EVmiRNA: a database of miRNA profiling in extracellular vesicles. Nucleic Acids Res. 2019 Jan 8;47(D1):D89-D93.

4. Hu H, Miao YR, Jia LH, Yu QY, Zhang Q, Guo AY#. AnimalTFDB 3.0: a comprehensive resource for annotation and prediction of animal transcription factors. Nucleic Acids Res. 2019 Jan 8;47(D1):D33-D38.

5. Liu CJ, Hu FF, Xia MX, Han L, Zhang Q#, Guo AY#. GSCALite: a web server for gene set cancer analysis. Bioinformatics. 2018 Nov 1;34(21):3771-3772.

6. Miao YR, Liu W, Zhang Q, Guo AY#. lncRNASNP2: an updated database of functional SNPs and mutations in human and mouse lncRNAs. Nucleic Acids Res. 2018 Jan 4;46(D1):D276-D280.

7. Zhang Q, Liu W, Liu C, Lin SY, Guo AY#. SEGtool: a specifically expressed gene detection tool and applications in human tissue and single-cell sequencing data. Brief Bioinform. 2018 Nov 27;19(6):1325-1336.

8. Gong J, Li Y, Liu CJ, Xiang Y, Li C, Ye Y, Zhang Z, Hawke DH, Park PK, Diao L, Putkey JA, Yang L, Guo AY#, Lin C#, Han L#. A Pan-cancer Analysis of the Expression and Clinical Relevance of Small Nucleolar RNAs in Human Cancer. Cell Rep. 2017 Nov 14;21(7):1968-1981.

9. Lei Q, Liu T, Gao F, Xie H, Sun L, Zhao A, Ren W, Guo H, Zhang L, Wang H, Chen Z, Guo AY#, Li Q#. Microvesicles as Potential Biomarkers for the Identification of Senescence in Human Mesenchymal Stem Cells. Theranostics. 2017 Jul 6;7(10):2673-2689.

10. Zhang HM, Li Q, Zhu X, Liu W, Hu H, Liu T, Cheng FJ, You Y, Zhong Z, Zou P, Li Q, Chen Z, Guo AY#. miR-146b-5p within BCR-ABL1-positive microvesicles promotes leukemic transformation of hematopoietic cells[J]. Cancer Research. 2016 May 15;76(10):2901-11.

            




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